Он дважды становился тренером команды.
В волгоградском «Роторе» вспомнили легендарного тренера Виктора Прокопенко. Накануне, 18 августа, отмечалась годовщина смерти Виктора Евгеньевича, которого не стало в 2007 году. В спортивном клубе подчеркнули, что с Прокопенко связаны самые выдающиеся страницы в истории «Ротора».
- Финал Кубка России 1994/1995, бронза чемпионата России-1996, серебро чемпионата России-1997, битвы с «Нантом» и «Манчестером Юнайтед» — мы помним и бережно храним в памяти эти моменты нашей истории, которые случились во многом благодаря Виктору Прокопенко, - отметили в клубе.
Впервые Виктор Прокопенко возглавил «Ротор» в 1987 году. Повторно вернулся в команду уже в 1994 году. Спустя год команда добилась громкого успеха, выбив из Кубка УЕФА «Манчестер Юнайтед». Матч в Волгограде завершился со счётом 0:0, а ответная игра в Великобритании – со счетом 2:2. Впоследствии Прокопенко являлся главным тренером московского «Динамо» и донецкого «Шахтера».